Meczet Isa Bey znajduje się w Selcuku, u podnóża wzgórza Ayasuluk, niedaleko bazyliki św. Jana i głównych stanowisk archeologicznych regionu. Zazwyczaj uwzględnia się go podczas spaceru po historycznej części miasta wraz z twierdzą Ayasuluk, muzeum w Efezie i ruinami starożytnego Efezu. Takie położenie sprawia, że meczet jest wygodnym przystankiem dla tych, którzy chcą zobaczyć nie tylko zabytki antyczne, ale także średniowieczną architekturę zachodniej Anatolii.

Budynek został wzniesiony w 1375 roku z polecenia Isy Beya z dynastii Aydinogullari. Meczet zalicza się do ważnych zabytków epoki anatolijskich bejlików, kiedy w architekturze łączyły się lokalne tradycje, dziedzictwo seldżuckie i nowe rozwiązania, które później rozwinęły się w okresie osmańskim. Właśnie dlatego jest on często wymieniany jako jeden z wyraźnych przykładów przejściowego etapu w islamskiej architekturze regionu.

Do budowy wykorzystano kamień i marmur, a także pojedyncze elementy z wcześniejszych budowli antycznych i bizantyjskich, co było powszechną praktyką tamtego czasu. W wyglądzie meczetu wyróżniają się rzeźbione portale, dekoracyjne kamienne wykończenie, arabskie inskrypcje oraz przemyślana kompozycja z wewnętrznym dziedzińcem i salą modlitewną. Pierwotnie budynek miał dwa minarety, jednak do naszych czasów zachowały się one tylko częściowo, podobnie jak część wystroju wnętrza.

Dziś meczet Isa Bey jest interesujący przede wszystkim dlatego, że pozwala lepiej zrozumieć wielowarstwową historię Selcuku. Na stosunkowo niewielkiej przestrzeni sąsiadują tu zabytki z okresu antycznego, bizantyjskiego i islamskiego, a meczet zajmuje w tym zestawieniu ważne miejsce. Wizyta szczególnie spodoba się tym, którzy interesują się architekturą, historią miasta i związkami między różnymi epokami w jednym krajobrazie kulturowym.